Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- _ -

• _CG_ABI_EXPERIMENTAL : embedsom_cuda_projection.cu
• _cuda_check() : embedsom_cuda.h

- a -

• add_approximation() : embedsom.cpp
• add_gravity() : embedsom.cpp
• addApproximation() : embedsom_cuda_projection.cu
• addApproximation2Wise() : embedsom_cuda_projection.cu
• addGravity() : embedsom_cuda_projection.cu
• addGravity2Wise() : embedsom_cuda_projection.cu

- b -

• bitonic_merge() : bitonic.cuh
• bitonic_merge_step() : bitonic.cuh
• bitonic_sort() : bitonic.cuh
• bitonic_topk_update_opt() : bitonic.cuh
• bubbleUp() : embedsom_cuda_knn.cu

- c -

• create_col_palette() : cluster_data.cpp
• CUCH : embedsom_cuda.h
• CUDA_CALLABLE_MEMBER : cuda_structs.cuh
• CUDA_STRUCTS_H : cuda_structs.cuh

- d -

• distance() : landmark_model.cpp
• do_del : pnorm.cpp
• DOIT : embedsom_cuda_projection.cu
• dotp_ec() : embedsom.cpp
• draw_menu_button() : ui_menu.cpp

- e -

• embedsom() : embedsom.cpp, embedsom.h
• embedsom_point() : embedsom.cpp
• ESOM_CUDA_BITONIC_CUH : bitonic.cuh
• euclideanProjection() : embedsom_cuda_projection.cu
• euclideanProjection4Wise() : embedsom_cuda_projection.cu

- g -

• getIndices() : embedsom_cuda_projection.cu
• getIndices< RectangleIndexer >() : embedsom_cuda_projection.cu
• GLFW_INCLUDE_NONE : input_handler.h, wrapper_glad.cpp, wrapper_glfw.h
• graph_e_fs : shaders.h
• graph_e_vs : shaders.h
• graph_layout_step() : graph_layout.cpp, graph_layout.h
• graph_v_fs : shaders.h
• graph_v_outline_fs : shaders.h
• graph_v_outline_vs : shaders.h
• graph_v_vs : shaders.h

- h -

• heap_down() : embedsom.cpp
• hsv2rgb() : cluster_data.cpp

- k -

• kmeans_landmark_step() : kmeans_landmark.cpp, kmeans_landmark.h
• knn() : embedsom.cpp
• koho_gravity : embedsom.cpp

- m -

• M_1_SQRT_2PI : pnorm.cpp
• M_SQRT_32 : pnorm.cpp
• main() : main.cpp
• make_knn_edges() : knn_edges.cpp, knn_edges.h
• max_avoidance : embedsom.cpp
• min_boost : embedsom.cpp

- p -

• parse_data() : fcs_parser.cpp
• parse_FCS() : fcs_parser.cpp, fcs_parser.h
• parse_generic() : parsers.cpp, parsers.h
• parse_id() : fcs_parser.cpp
• parse_info() : fcs_parser.cpp
• parse_TSV() : tsv_parser.cpp, tsv_parser.h
• pnorm_both() : pnorm.cpp
• pnormf() : pnorm.cpp, pnorm.h
• projectionAlignedShMemoryKernel() : embedsom_cuda_projection.cu
• projectionBaseKernel() : embedsom_cuda_projection.cu

- r -

• readAligned() : embedsom_cuda_projection.cu
• readAlignedGrid2D() : embedsom_cuda_projection.cu
• reset_button() : utils_imgui.hpp
• runnerWrapperBitonicOpt() : embedsom_cuda_knn.cu

- s -

• scatter_fs : shaders.h
• scatter_vs : shaders.h
• shift_interval() : utils.hpp
• SIXTEN : pnorm.cpp
• size_check : embedsom_cuda.cpp
• solve_lin_eq() : embedsom.cpp
• som_landmark_step() : kmeans_landmark.cpp, kmeans_landmark.h
• sorted_dists_to_scores() : embedsom.cpp
• sortedDistsToScores() : embedsom_cuda_projection.cu
• sortedDistsToScoresGroup() : embedsom_cuda_projection.cu
• split() : tsv_parser.cpp, utils.hpp
• sqeucl() : embedsom_cuda_knn.cu
• sqr() : kmeans_landmark.cpp, knn_edges.cpp
• sqrf() : embedsom.cpp, tsne_layout.cpp
• storeToCache() : embedsom_cuda_projection.cu
• swap_tail : pnorm.cpp

- t -

• tex_fs : shaders.h
• tex_vs : shaders.h
• TOOLS_HEIGHT : ui_menu.cpp
• tooltip() : utils_imgui.hpp
• topkBaseKernel() : embedsom_cuda_knn.cu
• topkBitonicOptKernel() : embedsom_cuda_knn.cu
• tsne_layout_step() : tsne_layout.cpp, tsne_layout.h

- u -

• ui_c_fs : shaders.h
• ui_c_vs : shaders.h
• ui_r_fs : shaders.h
• ui_r_vs : shaders.h

- v -

• valueMax : cuda_structs.cuh
• valueMax< double > : cuda_structs.cuh
• valueMax< float > : cuda_structs.cuh

- w -

• warpReduceSum() : embedsom_cuda_projection.cu
• WINDOW_PADDING : ui_menu.cpp
• WINDOW_WIDTH : ui_menu.cpp
• write_clusters() : ui_save.cpp
• write_data_2d() : ui_save.cpp
• write_data_float() : ui_save.cpp

- z -

• zero_avoidance : embedsom.cpp